BIULETYN INFORMACJI PUBLICZNEJ
  • Bip dodatkowe pola informatycjne:

    Wytwarzający: dr hab. inż. Emilia Pers-Kamczyc, prof. ID PAN
    Osoba publikująca: Wiesław Płócieniak

OGŁOSZENIE

O ZAMÓWIENIU Z DZIEDZINY NAUKI

(zaproszenie do składania ofert)

o wartości szacunkowej mniejszej niż progi unijne, których przedmiotem są dostawy lub usługi służące wyłącznie do celów prac badawczych, eksperymentalnych, naukowych lub rozwojowych, które nie służą prowadzeniu przez zamawiającego produkcji masowej służącej osiągnięciu rentowności rynkowej lub pokryciu kosztów badań lub rozwoju – art. 11 ust. 5 pkt 1 ustawy Prawo zamówień publicznych z 11 września 2019 r. (Dz. U. z 2026 r. poz. 793.).

Usługa genotypowania materiału DNA z wykorzystaniem platformy Affymetrix Axiom przy użyciu 2 płytek Axiom 384 4TREE 384S384 (Thermo Fisher Scientific) oraz dedykowanych odczynników.                      

  1. Opis przedmiotu zamówienia:
  • Przedmiotem zamówienia jest wykonanie usługi genotypowania materiału DNA z wykorzystaniem platformy Affymetrix Axiom przy użyciu 2 płytek Axiom 384 4TREE 384S384 (Thermo Fisher Scientific) oraz dedykowanych odczynników, obejmującej:
  • przygotowanie próbek do hybrydyzacji,
  • przeprowadzenie genotypowania na platformie Axiom,
  • przeprowadzenie kontroli jakości danych,
  • dostarczenie wyników wraz z raportem kontroli jakości (QC) w formacie elektronicznym uzgodnionym z Zamawiającym.
  • Zamawiający dostarczy 2 × 384 próbki DNA (łącznie 768 próbek), zgodnie z wymaganiami dotyczącymi ilości i stężenia określonymi przez Wykonawcę. W przypadku niespełnienia wymagań dotyczących jakości lub stężenia DNA, Wykonawca zobowiązany jest niezwłocznie poinformować Zamawiającego i uzgodnić dalsze postępowanie.
  • Zamawiający zobowiązuje się do dostarczenia Wykonawcy płytek oraz odczynników niezbędnych do przeprowadzenia procedury, przy czym sposób i miejsce dostawy zostaną ustalone na etapie realizacji zamówienia.
  • Przygotowanie próbek oraz procedura genotypowania muszą zostać przeprowadzone zgodnie
    z aktualnym protokołem zalecanym przez producenta płytki Axiom (Thermo Fisher Scientific). Przypisanie genotypów powinno zostać wykonane przy użyciu oprogramowania Axiom Analysis Suite, w wersji dostępnej w dniu realizacji zamówienia.
  • Wymagania dotyczące jakości danych genotypowych:

W ramach realizacji zamówienia Wykonawca zobowiązany jest do przeprowadzenia kontroli jakości uzyskanych danych genotypowych i zapewnienia, że spełniają one co najmniej następujące minimalne kryteria:

a) dish QC (DQC):

  • minimalna wartość akceptowalna: ≥ 0,80,
  • dopuszcza się warunkowo próbki z DQC ≥ 0,75, pod warunkiem spełnienia pozostałych kryteriów jakościowych (w szczególności marker call rate),
  • próbki o wartości DQC < 0,75 będą uznane za nieakceptowalne.

b) call rate dla markerów (Marker Call Rate / SNP Call Rate):

  • minimalna wartość: ≥ 95%,
  • w uzasadnionych przypadkach Zamawiający dopuszcza możliwość zastosowania niższego progu – ≥ 85%, pod warunkiem uzyskania spójnych i przydatnych danych genotypowych, co musi zostać potwierdzone w raporcie QC.

c) call rate dla próbek (Sample Call Rate):

  • nie stanowi obligatoryjnego kryterium oceny jakości wykonanej usługi, gdyż jego wartość zależy bezpośrednio od jakości materiału biologicznego dostarczonego przez Zamawiającego. Wykonawca jest jednak zobowiązany do przekazania wartości wskaźnika sample call rate dla każdej próbki w raporcie QC.
  • Zamawiający zastrzega sobie prawo do oceny jakości danych oraz żądania powtórzenia analizy
    w przypadku niespełnienia minimalnych kryteriów jakości.
  • Termin realizacji usługi: do 3 tygodni licząc od daty dostarczenia przez Zamawiającego materiału biologicznego oraz płytek i odczynników. Termin realizacji usługi Zamawiający rozumie jako termin przekazania wyników. 
  1. Termin związania ofertą – 14 dni tj. do 12 sierpnia 2026 r.
  2. Oferty wg wzoru stanowiącego załącznik nr 1 powinny zawierać proponowaną cenę na wszystkie elementy zamówienia ujęte w opisie.
  3. Cenę za wykonanie zamówienia Wykonawca określi w złotych z dokładnością do dwóch miejsc po przecinku. Cena powinna obejmować wszystkie koszty realizacji zamówienia. Zastosowanie przez Wykonawcę stawki podatku od towarów i usług (VAT) niezgodnej z obowiązującymi przepisami prawa, w szczególności ustawą z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług, może skutkować odrzuceniem oferty. Zamawiający w celu ustalenia, czy oferta zawiera rażąco niską cenę w stosunku do przedmiotu zamówienia, może zwrócić się do Wykonawcy o udzielenie w określonym terminie wyjaśnień dotyczących elementów oferty mających wpływ na wysokość ceny.
  4. Jedynym kryterium wyboru oferty jest cena brutto. Za najkorzystniejszą ofertę uznana zostanie ważna oferta z najniższą ceną.
  5. Z Wykonawcą, którego oferta zostanie uznana za najkorzystniejszą zostanie podpisana umowa wg wzoru załącznika nr 2 do ogłoszenia (dotyczy zamówienia na kwotę powyżej 25000,00 zł netto) lub zostanie wysłane pisemne zamówienie (kwota poniżej 25000,00 zł netto).
  6. Wynagrodzenie należne Wykonawcy będzie płatne na podstawie prawidłowo wystawionej faktury VAT, z terminem płatności 14 dni, od daty jej otrzymania przez Zamawiającego.
  7. Podstawą wystawienia faktury jest podpisanie przez Strony protokołu odbioru potwierdzającego wykonanie usługi, rozumianej jako przekazanie kompletu wyników (załącznik nr 4 do ogłoszenia).
  8. Zamawiający zastrzega sobie prawo unieważnienia postępowania bez podania przyczyny. Od tej decyzji nie przysługują środki odwoławcze.
  9. Oferty należy składać do dnia 30 lipca 2026 roku, do godziny 10:00, przesyłając je pocztą elektroniczną na adres: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. z dopiskiem w tytule wiadomości: „Oferta cenowa na wykonanie usługi genotypowania materiału DNA z wykorzystaniem platformy Affymetrix Axiom, znak sprawy: DAZ.2540.571.2026”.
  10. Osobą do kontaktu w sprawie zamówienia pod względem formalno-proceduralnym jest Klaudia Olejniczak, tel.: 663730893; e-mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. w godzinach od 7:30 do 15:30.

Zastępca dyrektora ds. organizacji i rozwoju
Instytutu Dendrologii PAN

dr hab. inż. Emilia Pers-Kamczyc, prof. ID PAN

Kórnik 23.07.2026 r.

Złączniki:

Nr 1 Formularz ofertowy,

Nr 2 Wzór umowy,                                                                                    

Nr 3 Klauzula RODO,

Nr 4 Wzór protokołu.

 Pobierz załączniki