Szczegóły

Autor: 30 lipca 2024

Kategoria: Zamówienia z dziedziny nauki 2024

Opublikowano: 22 lipca 2024

Odsłon: 220

• Bip dodatkowe pola informatycjne:

  Wytwarzający: prof. dr hab. inż. Andrzej M. Jagodziński
  Osoba publikująca: Grzegorz Płócieniak

OGŁOSZENIE

O ZAMÓWIENIU Z DZIEDZINY NAUKI

(zaproszenie do składania ofert)

   Wynik

o wartości szacunkowej mniejszej niż progi unijne, których przedmiotem są dostawy lub usługi służące wyłącznie do celów prac badawczych, eksperymentalnych, naukowych lub rozwojowych, które nie służą prowadzeniu przez zamawiającego produkcji masowej służącej osiągnięciu rentowności rynkowej lub pokryciu kosztów badań lub rozwoju – art. 11 ust. 5 pkt
1 ustawy Prawo zamówień publicznych z 11 września 2019 r. (Dz. U. z 2023 r. poz. 1605, 1720

z późn. zm.).

1. Opis przedmiotu zamówienia:

• Analiza 55 próbek ekstraktów białkowych metodą LC-MS/MS oraz identyfikacji białek roślinnych z wykorzystaniem dostępnych baz danych. Analizy proteomiczne roślinnych ekstraktów białkowych wykonane mają być metodą „bottom up” w układzie nano-LC/MS, pozwalającą na jednoczesną identyfikację dużej ilości białek oraz ich względny pomiar ilościowy.
• W celu wykonania eksperymentu przeprowadzona zostanie izolacja białek poprzez ekstrakcję do fazy fenolowej, następnie zostanie wykonany pomiar stężenia białek (BCA). Trawienie proteolityczne (trypsyna) w celu uzyskania mieszaniny krótkich peptydów zostanie wykonane w ramach usługi. Tak uzyskana mieszanina peptydów będzie analizowana w układzie
  nano-LC/MS składającym się z chromatografu Dionex nanoRLSC 3000 oraz wysokorozdzielczego spektrometru mas Thermo QExactive (analizator typu Orbitrap, rozdzielczość minimalna: 140 000). Dokładność pomiaru masy poniżej 1 ppm z kalibracją zewnętrzną.
• W wyniku analizy próbek uzyskane zostaną chromatogramy na które składają się widma MS (pełne skany) oraz widma MS/MS uzyskane w trybie zależnym od danych (Data Dependant Analysis). Dane te zostaną użyte do przeszukiwania proteomicznych baz sekwencji aminokwasowych roślinnych białek w celu uzyskania informacji jakościowych oraz ilościowych (np. Swiss-Prot). Do analiz zostanie użyte zaawansowane oprogramowanie bazodanowe Proteome Discoverer 2.2 wykorzystujące algorytmy SequestHT do analizy widm i sekwencji białek. Uzyskane wyniki dalej będą procesowane w programie Perseus (MaxQuant) pozwalającym na prowadzenie analiz statystycznych oraz funkcjonalnych.
• Wymagane jest, aby Zamawiający miał dostęp do wszystkich uzyskanych danych (również surowych). Dane powinny być dostarczone w formie cyfrowej.
• Materiał do analiz zostanie dostarczony w terminie co najmniej 30 dni przed terminem realizacji zamówienia. Dostawa prób na koszt Wykonawcy.

2. Termin związania ofertą – 14 dni tj. do dnia 12 sierpnia 2024 r.
3. Termin wykonania usługi – do 15 listopada 2024 r. Termin realizacji Zamawiający rozumie jako termin przekazania wyników. 
4. Oferty wg wzoru stanowiącego załącznik nr 1 powinny zawierać proponowaną cenę
   na wszystkie elementy zamówienia ujęte w opisie.
5. Cenę za wykonanie zamówienia Wykonawca określi w złotych z dokładnością do dwóch miejsc po przecinku na wszystkie elementy zamówienia. Zamawiający w celu ustalenia, czy oferta zawiera rażąco niską cenę w stosunku do przedmiotu zamówienia, może zwrócić się do Wykonawcy o udzielenie w określonym terminie wyjaśnień dotyczących elementów oferty mających wpływ na wysokość ceny. Zastosowanie przez Wykonawcę stawki podatku VAT od towarów i usług niezgodnego z przepisami ustawy o podatku od towarów i usług oraz podatku akcyzowego z 11.03.2004 r. (Dz. U. 04.54.535 z póź. zm.) spowoduje odrzucenie oferty. Cena powinna zawierać wszystkie koszty realizacji zamówienia razem z dostawą do siedziby Zamawiającego.
6. Jedynym kryterium wyboru oferty jest cena brutto. Za najkorzystniejszą ofertę uznana zostanie ważna oferta z najniższą ceną.
7. Z Wykonawcą, którego oferta zostanie uznana za najkorzystniejszą zostanie podpisana umowa wg wzoru załącznika nr 2 do ogłoszenia (dotyczy zamówienia na kwotę powyżej 15000,00 zł netto) lub zostanie wysłane pisemne zamówienie (kwota poniżej 15000,00 zł netto).
8. Warunkiem zapłaty jest sporządzenie przez strony tej umowy protokołu odbioru przedmiotu usługi lub jej części – załącznik nr 4.
9. Zamawiający zastrzega sobie prawo unieważnienia postępowania bez podania przyczyny. Od tej decyzji nie przysługują środki odwoławcze.
10. Oferty należy składać w zamkniętych kopertach z dopiskiem: „Oferta cenowa na wykonanie analiza 55 próbek ekstraktów białkowych metodą LC-MS/MS oraz identyfikacji białek roślinnych znak sprawy: DAZ.2540.563.2024” do 30 lipca 2024 roku skrzynce podawczej Instytutu 
    portiernia budynku A do godz. 14:00 lub przesłać pocztą elektroniczną na adres: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
11. Osobą do kontaktu w sprawie zamówienia pod względem formalno-proceduralnym jest Klaudia Olejniczak, tel.: 663730893; e-mail: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. w godzinach od 7:30 do 15:30.

Złączniki:

Nr 1 Formularz ofertowy,

Nr 2 Wzór umowy,                                                                                    

Nr 3 Klauzula RODO,

Nr 4 Wzór protokołu.

 Pobierz

Dyrektor Instytutu Dendrologii

Polskiej Akademii Nauk

prof. dr hab. inż. Andrzej M. Jagodziński

Kórnik 19.07.2024 r.