Wykonanie analizy metagenomicznej 60 prób DNA ze środowiska dla Instytutu Dendrologii PAN

OGŁOSZENIE

O ZAMÓWIENIU Z DZIEDZINY NAUKI

(zaproszenie do składania ofert)

o wartości szacunkowej mniejszej niż progi unijne, których przedmiotem są dostawy lub usługi służące wyłącznie do celów prac badawczych, eksperymentalnych, naukowych lub rozwojowych, które nie służą prowadzeniu przez zamawiającego produkcji masowej służącej osiągnięciu rentowności rynkowej lub pokryciu kosztów badań lub rozwoju – art. 11 ust. 5 pkt 1 ustawy Prawo zamówień publicznych z 11 września 2019 r. (Dz. U. z 2024 r. poz. 1320 z późn. zm.).                  

1. Opis przedmiotu zamówienia:

Przedmiotem zamówienia jest wykonanie analizy metagenomicznej 60 prób DNA ze środowiska.

W zakres świadczonej usługi wchodzą:

• Izolacja DNA z dostarczonych prób glebowych. Izolacja całkowitego DNA z wykorzystaniem zestawów do izolacji DNA z gleby, zapewniającego uzyskanie DNA o wysokiej czystości.
• Przygotowanie bibliotek dla regionu ITS2 z amplikonów pochodzących z trzech niezależnych reakcji PCR dla każdej próby. Amplikony przygotowane będą z wykorzystaniem starterów gITS7 (5’-GTG ART CAT CGA RTC TTT G-3’) i ITS4 (5’-TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC-3’).
• Wykonanie wysokoprzepustowego sekwencjonowania przygotowanych 60 bibliotek z użyciem technologii Illumina na sekwenatorze Novaseq6000 PE250 z zestawem odczynników umożliwiających odczyt sparowanych odczytów o długościach 2x250 nukleotydów. Wymagana min. ilość odczytów dla każdego amplikonu to 200 000.
• Podstawowa analiza bioinformatyczna w ramach której uzyskane wyniki zostaną przefiltrowane – rozdzielone na poszczególne próby, usunięte sekwencje o niskiej jakości, wyodrębnione zostaną warianty sekwencji amplikonów ASV (Amplicon Sequence Variants), będzie wykonana analiza taksonomiczna próbek (w oparciu o bazę UNITE) oraz przypisanie ich do grup troficznych w oparciu o FunGuild.
• Wymagane jest, aby zamawiający miał dostęp do wszystkich uzyskanych danych (także surowych odczytów). Dane powinny być dostępne w trybie on-line, jak również dostarczone w formie cyfrowej. Wykonawca nie będzie rościć sobie żadnych praw autorskich do wygenerowanych danych i nie będzie ich wykorzystywał w jakikolwiek sposób do własnych celów (np. budowa bazy danych). Dane zostaną nieodwracalnie usunięte po maksymalnie 6 miesiącach od wykonania całości usługi lub na wyraźne życzenie Zamawiającego.
• Materiał do analiz zostanie dostarczony jednorazowo, w terminie co najmniej 35 dni przed terminem realizacji zamówienia. Materiał dostarczony zostanie w formie zamrożonej (w suchym lodzie). Dostawa prób na koszt Wykonawcy. Waga pojedynczej próby: do 20 g.
• Termin wykonania usługi – do 30 dni roboczych od dostarczenia materiału badawczego. Termin wykonania usługi Zamawiający rozumie jako termin przekazania wyników. 

2. Termin związania ofertą – 14 dni tj. do 16.09.25 r.
3. Oferty wg wzoru stanowiącego załącznik nr 1 powinny zawierać proponowaną cenę na wszystkie elementy zamówienia ujęte w opisie.
4. Cenę za wykonanie zamówienia Wykonawca określi w złotych z dokładnością do dwóch miejsc po przecinku na wszystkie elementy zamówienia. Zamawiający w celu ustalenia, czy oferta zawiera rażąco niską cenę w stosunku do przedmiotu zamówienia, może zwrócić się do Wykonawcy o udzielenie w określonym terminie wyjaśnień dotyczących elementów oferty mających wpływ na wysokość ceny. Zastosowanie przez Wykonawcę stawki podatku VAT od towarów i usług niezgodnego z przepisami ustawy o podatku od towarów i usług oraz podatku akcyzowego z 11.03.2004 r. (Dz. U. 04.54.535 z póź. zm.) spowoduje odrzucenie oferty. Cena powinna zawierać wszystkie koszty realizacji zamówienia.
5. Jedynym kryterium wyboru oferty jest cena brutto. Za najkorzystniejszą ofertę uznana zostanie ważna oferta z najniższą ceną.
6. Z Wykonawcą, którego oferta zostanie uznana za najkorzystniejszą zostanie podpisana umowa wg wzoru załącznika nr 2 do ogłoszenia (dotyczy zamówienia na kwotę powyżej 15000,00 zł netto) lub zostanie wysłane pisemne zamówienie (kwota poniżej 15000,00 zł netto).
7. Warunkiem zapłaty jest sporządzenie przez strony tej umowy protokołu odbioru przedmiotu usługi lub jej części – załącznik nr 4.
8. Zamawiający zastrzega sobie prawo unieważnienia postępowania bez podania przyczyny. Od tej decyzji nie przysługują środki odwoławcze.
9. Oferty należy składać w zamkniętych kopertach z dopiskiem: „Oferta cenowa na wykonanie analizy metagenomicznej 60 prób DNA ze środowiska znak sprawy: DAZ.2540.746.2025” do 03.09.25 r. w skrzynce podawczej Instytutu portiernia budynku A, do godz. 10:00 lub przesłać pocztą elektroniczną na adres: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript..

10. Osobą do kontaktu w sprawie zamówienia pod względem formalno-proceduralnym jest Damian Maciejewski, tel.: 796 360 310; e-mail: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. w godzinach od 7:30 do 15:30.

Złączniki:

Nr 1 Formularz ofertowy,

Nr 2 Wzór umowy,                                                                                    

Nr 3 Klauzula RODO,

Nr 4 Wzór protokołu.

 Pobierz załączniki

Kórnik 27.08.2025 r.