OGŁOSZENIE
O ZAMÓWIENIU Z DZIEDZINY NAUKI
(zaproszenie do składania ofert)
o wartości szacunkowej mniejszej niż progi unijne, których przedmiotem są dostawy lub usługi służące wyłącznie do celów prac badawczych, eksperymentalnych, naukowych lub rozwojowych, które nie służą prowadzeniu przez zamawiającego produkcji masowej służącej osiągnięciu rentowności rynkowej lub pokryciu kosztów badań lub rozwoju – art. 11 ust. 5 pkt 1 ustawy Prawo zamówień publicznych z 11 września 2019 r. (Dz. U. z 2024 r. poz. 1320, z 2025 r. poz. 620, 769, 794, 1165, 1173, 1235 z późn. zm..).
1. Opis przedmiotu zamówienia:
Przedmiotem zamówienia jest:
• Wykonanie usługi genotypowania materiału DNA z wykorzystaniem platformy Affymetrix Axiom przy użyciu płytki Axiom 384 4TREE 384S384 (Thermo Fisher Scientific), obejmującej:
- przygotowanie próbek do hybrydyzacji,
- przeprowadzenie genotypowania na platformie Axiom,
- przeprowadzenie kontroli jakości danych,
- dostarczenie wyników wraz z raportem kontroli jakości (QC) w formacie elektronicznym uzgodnionym z Zamawiającym.
• Zamawiający na własny koszt dostarczy 384 próbki DNA, zgodnie z wymaganiami dotyczącymi ilości i stężenia określonymi przez Wykonawcę. W przypadku niespełnienia wymagań dotyczących jakości lub stężenia DNA, Wykonawca zobowiązany jest niezwłocznie poinformować Zamawiającego i uzgodnić dalsze postępowanie.
• Zamawiający zobowiązuje się do dostarczenia Wykonawcy na własny koszt: płytkę, odczynniki oraz materiały zużywalne, niezbędne do przeprowadzenia procedury, zgodnie z poniższym zestawieniem:
- 1 x płytka do genotypowania DNA – AXIOM 4TREE 384S384 (Thermo Fisher Scientific, numer katalogowy: 551221),
- 1 x kit Axiom 384HT GT CONS (Thermo Fisher Scientific, numer katalogowy: 902234AG),
- 1 x kit Axiom 2.0 384HT RGTS AG (Thermo Fisher Scientific, numer katalogowy: 902245AG).
• Przygotowanie próbek oraz procedura genotypowania muszą zostać przeprowadzone zgodnie z aktualnym protokołem zalecanym przez producenta płytki Axiom (Thermo Fisher Scientific). Przypisanie genotypów powinno zostać wykonane przy użyciu oprogramowania Axiom Analysis Suite, w wersji dostępnej w dniu realizacji zamówienia.
• Wymagania dotyczące jakości danych genotypowych:
W ramach realizacji zamówienia Wykonawca zobowiązany jest do przeprowadzenia kontroli jakości uzyskanych danych genotypowych i zapewnienia, że spełniają one co najmniej następujące minimalne kryteria:
a) dish QC (DQC):
- minimalna wartość akceptowalna: ≥ 0,80,
- dopuszcza się warunkowo próbki z DQC ≥ 0,75, pod warunkiem spełnienia pozostałych kryteriów jakościowych (w szczególności marker call rate),
- próbki o wartości DQC < 0,75 będą uznane za nieakceptowalne.
b) call rate dla markerów (Marker Call Rate / SNP Call Rate):
- minimalna wartość: ≥ 95%,
- w uzasadnionych przypadkach Zamawiający dopuszcza możliwość zastosowania niższego progu – ≥ 85%, pod warunkiem uzyskania spójnych i przydatnych danych genotypowych, co musi zostać potwierdzone w raporcie QC.
c) call rate dla próbek (Sample Call Rate):
- nie stanowi obligatoryjnego kryterium oceny jakości wykonanej usługi, gdyż jego wartość zależy bezpośrednio od jakości materiału biologicznego dostarczonego przez Zamawiającego. Wykonawca jest jednak zobowiązany do przekazania wartości wskaźnika sample call rate dla każdej próbki w raporcie QC.
• Zamawiający zastrzega sobie prawo do oceny jakości danych oraz żądania powtórzenia analizy w przypadku niespełnienia minimalnych kryteriów jakości.
• Wykonawca zapewni dostęp do wyników w formie on-line.
• Próbki oraz materiały zużywalne i odczynniki Zamawiający dostarczy w ciągu 2 tygodni od momentu podpisania umowy.
2. Termin wykonania usługi – maksymalny czas realizacji: do 4 tygodni od momentu dostarczenia materiału biologicznego oraz odczynników i materiałów zużywalnych przez Zamawiającego.
3. Termin związania ofertą – 14 dni tj. do 2 lutego 2026 r.
4. Oferty wg wzoru stanowiącego załącznik nr 1 powinny zawierać proponowaną cenę na wszystkie elementy zamówienia ujęte w opisie.
5. Cenę za wykonanie zamówienia Wykonawca określi w złotych z dokładnością do dwóch miejsc po przecinku na wszystkie elementy zamówienia. Zamawiający w celu ustalenia, czy oferta zawiera rażąco niską cenę w stosunku do przedmiotu zamówienia, może zwrócić się do Wykonawcy o udzielenie w określonym terminie wyjaśnień dotyczących elementów oferty mających wpływ na wysokość ceny. Zastosowanie przez Wykonawcę stawki podatku VAT od towarów i usług niezgodnego z przepisami ustawy z dnia 24 stycznia 2025 r. o zmianie ustawy o podatku od towarów i usług, ustawy o podatku akcyzowym oraz niektórych innych ustaw (Dz.U. 2025 poz. 222) spowoduje odrzucenie oferty. Cena powinna zawierać wszystkie koszty realizacji zamówienia.
6. Jedynym kryterium wyboru oferty jest cena brutto. Za najkorzystniejszą ofertę uznana zostanie ważna oferta z najniższą ceną.
7. Z Wykonawcą, którego oferta zostanie uznana za najkorzystniejszą zostanie podpisana umowa wg wzoru załącznika nr 2 do ogłoszenia (dotyczy zamówienia na kwotę równą lub powyżej 25000,00 zł netto) lub zostanie wysłane pisemne zamówienie (kwota poniżej 25000,00 zł netto).
8. Wynagrodzenie należne Wykonawcy będzie płatne na podstawie prawidłowo wystawionej faktury VAT, z terminem płatności 21 dni od daty jej otrzymania przez Zamawiającego. Warunkiem zapłaty jest sporządzenie przez strony protokołu odbioru przedmiotu usługi lub jej części – załącznik nr 4.
9. Zamawiający zastrzega sobie prawo unieważnienia postępowania bez podania przyczyny. Od tej decyzji nie przysługują środki odwoławcze.
10. Oferty należy składać w zamkniętych kopertach z dopiskiem: „Oferta cenowa na wykonanie usługi genotypowania materiału DNA z wykorzystaniem platformy Affymetrix Axiom”, znak sprawy: DAZ.2540.38.2026” do 26 stycznia 2026 roku do godz. 10:00 na portierni w budynku A Instytutu lub przesłać pocztą elektroniczną na adres:
11. Osobą do kontaktu w sprawie zamówienia pod względem formalno-proceduralnym jest Wiesław Płócieniak, tel.: 601 857 261; e-mail:
Dyrektor Instytutu Dendrologii
Polskiej Akademii Nauk
prof. dr hab. inż. Andrzej M. Jagodziński
członek korespondent PAN
Kórnik 19.01.2026 r.
Złączniki:
Nr 1 Formularz ofertowy,
Nr 2 Wzór umowy,
Nr 3 Klauzula RODO,
Nr 4 Wzór protokołu.