OGŁOSZENIE
O ZAMÓWIENIU Z DZIEDZINY NAUKI
(zaproszenie do składania ofert)
o wartości szacunkowej mniejszej niż progi unijne, których przedmiotem są dostawy lub usługi służące wyłącznie do celów prac badawczych, eksperymentalnych, naukowych lub rozwojowych, które nie służą prowadzeniu przez zamawiającego produkcji masowej służącej osiągnięciu rentowności rynkowej lub pokryciu kosztów badań lub rozwoju – art. 11 ust. 5 pkt 1 ustawy Prawo zamówień publicznych z 11 września 2019 r. (Dz. U. z 2024 r. poz. 1320 z późn. zm.).
- Opis przedmiotu zamówienia:
Przedmiotem zamówienia jest wykonanie usługi izolacji DNA, a następnie przeprowadzenie analiz metagenomicznych grzybów glebowych otrzymanych z próbek środowiskowych (martwa materia organiczna w stanie suchym).
Zamawiający w momencie ogłaszania oferty deklaruje przesłanie minimalnej ilości prób do sekwencjonowania w liczbie 120 prób. Masa każdej przesłanej do analiz prób będzie wynosiła
2-5gr.
1) Zakres zamówienia obejmuje:
- Izolacja DNA z dostarczonych prób. Izolacja całkowitego DNA powinna zostać wykona
z wykorzystaniem zestawów przeznaczonych do izolacji DNA z prób środowiskowych, zapewniających uzyskanie DNA o wysokiej czystości, nawet dla prób trudnych charakteryzujących się dużą ilością frakcji pylastych, np. DNeasy PowerSoil Pro Kit. - Przygotowanie bibliotek dla regionu ITS z amplikonów pochodzących z trzech niezależnych reakcji PCR dla każdej dostarczonej matrycy (360 reakcji PCR).
- Biblioteki zweryfikowane zostaną pod względem jakościowym przy użyciu qPCR, a następnie sprawdzone pod kątem długości fragmentów przy użyciu Bioanalyzer 2100 oraz Qubit.
- Wykonanie wysokoprzepustowego sekwencjonowania - metabarkodingu długich fragmentów (ITS1-5.8S-ITS2) przygotowanych 120 bibliotek z wykorzystaniem technologii PacBio Sequel II oraz starterów ITS9munngs + ITS4ngsUni**. Wymagana minimalna ilość odczytów dla każdego amplikonu wynosi 20 000.
- Podstawowa analiza bioinformatyczna w ramach której uzyskane wyniki zostaną przefiltrowane – rozdzielone na poszczególne próby, usunięte zostaną sekwencje o niskiej jakości, wyodrębnione zostaną jednostki taksonomiczne - OTU (Operational Taxonomic Unit) do poziomu gatunku, wykonana zostanie analiza taksonomiczna próbek (w oparciu o bazę UNITE)
2) Wymagane jest, aby zamawiający miał dostęp do wszystkich uzyskanych danych (również surowych odczytów). Dane powinny umieszczone na serwerze plików/dysku sieciowym, jak również dostarczone w formie cyfrowej na nośniku (np. pendrive) w postaci plików *.fastq, *.fna, *.txt, *.bion, *.xlsx. Pliki w formie on-line powinny być dostępne przez sześć miesięcy od daty zakończenia zlecenia, a dostęp do nich musi być zahasłowany. Piliki powinny być spakowane programem 7Zip z opcją szyfrowania danych.
3) Materiał do analiz zostanie dostarczony jednorazowo, w terminie co najmniej 40 dni przed terminem realizacji usługi na koszt Wykonawcy.
4) Termin wykonania usługi: do 24.06.2026 r. Termin wykonania całości usługi Zamawiający rozumie jako termin przekazania wyników.
** Tedersoo L, Anslan S. 2019. Towards PacBio-based pan-eukaryote metabarcoding using full-length ITS sequences. Environ Microbiol Rep 11(5):659-668
- Termin związania ofertą – 14 dni tj. do 10 maja 2026 r.
- Oferty wg wzoru stanowiącego załącznik nr 1 powinny zawierać proponowaną cenę na wszystkie elementy zamówienia ujęte w opisie.
- Cenę za wykonanie zamówienia Wykonawca określi w złotych z dokładnością do dwóch miejsc po przecinku. Cena powinna obejmować wszystkie koszty realizacji zamówienia. Zastosowanie przez Wykonawcę stawki podatku od towarów i usług (VAT) niezgodnej z obowiązującymi przepisami prawa, w szczególności ustawą z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług, może skutkować odrzuceniem oferty. Zamawiający w celu ustalenia, czy oferta zawiera rażąco niską cenę w stosunku do przedmiotu zamówienia, może zwrócić się do Wykonawcy o udzielenie w określonym terminie wyjaśnień dotyczących elementów oferty mających wpływ na wysokość ceny.
- Jedynym kryterium wyboru oferty jest cena brutto. Za najkorzystniejszą ofertę uznana zostanie ważna oferta z najniższą ceną.
- Z Wykonawcą, którego oferta zostanie uznana za najkorzystniejszą zostanie podpisana umowa wg wzoru załącznika nr 2 do ogłoszenia (dotyczy zamówienia na kwotę powyżej 25000,00 zł netto) lub zostanie wysłane pisemne zamówienie (kwota poniżej 25000,00 zł netto).
- Wynagrodzenie należne Wykonawcy będzie płatne na podstawie prawidłowo wystawionej faktury VAT, z terminem płatności 14 dni, od daty jej otrzymania przez Zamawiającego. Warunkiem zapłaty jest sporządzenie przez strony protokołu odbioru przedmiotu usługi lub jej części – załącznik nr 4.
- Zamawiający zastrzega sobie prawo unieważnienia postępowania bez podania przyczyny. Od tej decyzji nie przysługują środki odwoławcze.
- Oferty należy składać do dnia 27 kwietnia 2026 roku, do godziny 10:00, przesyłając je pocztą elektroniczną na adres:
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. z dopiskiem w tytule wiadomości: „Oferta cenowa na wykonanie usługi izolacji DNA oraz analizy metagenomicznej z prób środowiskowych dla 120 prób, znak sprawy: DAZ.2540.337.2026”. - Osobą do kontaktu w sprawie zamówienia pod względem formalno-proceduralnym jest Klaudia Olejniczak, tel.: 663730893; e-mail:
Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript. w godzinach od 7:30 do 15:30.
Dyrektor Instytutu Dendrologii
Polskiej Akademii Nauk
prof. dr hab. inż. Andrzej M. Jagodziński
członek korespondent PAN
Kórnik 17.04.2026 r.
Złączniki:
Nr 1 Formularz ofertowy,
Nr 2 Wzór umowy,
Nr 3 Klauzula RODO,
Nr 4 Wzór protokołu.