Polski Węzeł GBIF

Global Biodiversity Information Facility (GBIF) to międzynarodowa sieć oraz infrastruktura informacyjna, która od ponad dwóch dekad umożliwia otwarty i bezpłatny dostęp do danych o organizmach żywych na całym świecie. Inicjatywa ta jest finansowana przez rządy wielu państw i odpowiada na rosnące zapotrzebowanie na wiarygodne dane w obliczu globalnych wyzwań, takich jak utrata bioróżnorodności oraz zmiany klimatyczne. Dane udostępniane przez GBIF wspierają zarówno badania naukowe, jak i procesy decyzyjne na poziomie lokalnym i międzynarodowym.

Działalność GBIF jest koordynowana przez sekretariat z siedzibą w Kopenhadze. Sieć tworzą kraje oraz organizacje partnerskie, które współpracują w ramach wspólnej infrastruktury. Każdy z członków posiada własny węzeł krajowy lub instytucjonalny, odpowiedzialny za koordynację działań oraz publikację danych na poziomie lokalnym.

Członkostwo w GBIF ma charakter dobrowolny i formalizowane jest poprzez podpisanie porozumienia określającego zasady współpracy, w tym zobowiązanie do wspierania otwartego dostępu do danych o bioróżnorodności. Państwa członkowskie oraz współpracujące instytucje przyczyniają się do realizacji celów Convention on Biological Diversity (CBD), m.in. poprzez udostępnianie danych i rozwój systemów monitorowania.

Społeczność GBIF stale się rozwija, skupiając ekspertów i instytucje zaangażowane w promowanie otwartości danych i współpracy międzynarodowej.

Polska należy do grona pełnoprawnych członków GBIF i posiada prawo głosu w kwestiach dotyczących kierunku rozwoju tej inicjatywy. Krajowy węzeł GBIF działa przy Uniwersytet Warszawski, gdzie zespół specjalistów odpowiada za koordynację działań oraz wspieranie instytucji publikujących dane.

Powstanie GBIF było wynikiem rekomendacji grupy ds. informatyki bioróżnorodności działającej przy Organisation for Economic Co-operation and Development. Podkreślono wówczas potrzebę stworzenia globalnego mechanizmu umożliwiającego powszechny dostęp do danych o różnorodności biologicznej, co miało przynieść zarówno korzyści naukowe, jak i społeczne.

Kluczowym elementem funkcjonowania GBIF jest dbałość o jakość danych. Publikowane są wyłącznie zbiory pochodzące bezpośrednio od instytucji naukowych i organizacji posiadających odpowiednie kompetencje. Do grona wydawców należą głównie uczelnie, instytuty badawcze, jednostki administracji publicznej oraz czasopisma naukowe. Osoby indywidualne publikują dane za pośrednictwem tych instytucji lub krajowych węzłów GBIF.

GBIF dostarcza narzędzi, standardów oraz dobrych praktyk, które umożliwiają instytucjom z całego świata efektywne udostępnianie danych. Informacje te obejmują m.in. dane o występowaniu gatunków w czasie i przestrzeni, pochodzące z bardzo różnorodnych źródeł – od historycznych zbiorów muzealnych po współczesne dane genetyczne czy obserwacje terenowe.

Ważną rolę odgrywają także inicjatywy nauki obywatelskiej, takie jak iNaturalist, które umożliwiają użytkownikom dokumentowanie obserwacji przyrodniczych za pomocą urządzeń mobilnych.

Integracja danych w GBIF opiera się na wspólnych standardach, w szczególności na Darwin Core, który stanowi podstawę struktury większości zbiorów dostępnych w systemie. Dzięki temu możliwe jest łączenie setek milionów rekordów pochodzących z różnych źródeł w jedną spójną bazę danych.

Wszystkie dane udostępniane przez GBIF publikowane są na jednej z licencji Creative Commons, co zapewnia ich otwartość i możliwość szerokiego wykorzystania. Dane te mogą być używane m.in. w badaniach naukowych, monitoringu środowiska, zarządzaniu zasobami przyrodniczymi czy planowaniu działań ochronnych.

Każdy zbiór danych otrzymuje unikalny identyfikator DOI, co umożliwia jego trwałe cytowanie oraz łatwy dostęp do źródła informacji.

Darwin Core to międzynarodowy standard służący do opisu danych o bioróżnorodności. Umożliwia on jednolite zapisywanie informacji o gatunkach oraz ich występowaniu, dzięki czemu dane pochodzące z różnych źródeł mogą być łatwo łączone, analizowane i udostępniane na skalę globalną.

Dlaczego Darwin Core jest ważny?

W projektach takich jak Global Biodiversity Information Facility (GBIF) kluczowe znaczenie ma spójność danych. Standard Darwin Core zapewnia wspólny „język”, który pozwala instytucjom z całego świata publikować dane w sposób porównywalny i interoperacyjny.

Dzięki temu możliwe jest:

• łączenie danych z różnych baz i krajów,
• prowadzenie analiz na dużą skalę (np. zmiany zasięgów gatunków),
• wykorzystanie danych w badaniach naukowych i ochronie przyrody.
  
  

Darwin Core umożliwia opisywanie m.in.:

• nazw naukowych organizmów,
• lokalizacji geograficznej (np. współrzędnych),
• daty obserwacji lub zebrania próbki,
• źródła danych (np. kolekcja muzealna, obserwacja terenowa),
• informacji o obserwatorze lub instytucji.

Standard ten jest elastyczny – można go dostosować do różnych typów danych, od historycznych okazów muzealnych po współczesne obserwacje terenowe i dane molekularne.

Publikowanie danych w Darwin Core:

Dane publikowane w standardzie Darwin Core są najczęściej udostępniane poprzez narzędzia GBIF, takie jak IPT (Integrated Publishing Toolkit). Dzięki temu:

• dane są automatycznie walidowane,
• otrzymują trwały identyfikator (DOI),
• stają się dostępne dla użytkowników na całym świecie.

Stosowanie Darwin Core jest obecnie jednym z podstawowych wymogów publikowania danych w GBIF i gwarantuje ich wysoką jakość oraz użyteczność.

Publikowanie danych w GBIF odbywa się w oparciu o regulacje prawne oraz standardy międzynarodowe dotyczące udostępniania danych, ich ponownego wykorzystania oraz ochrony informacji.

Regulacje Unii Europejskiej:

Dyrektywa INSPIRE: https://eur-lex.europa.eu/legal-content/PL/TXT/?uri=CELEX:32007L0002

Open Data Directive: https://eur-lex.europa.eu/legal-content/PL/TXT/?uri=CELEX:32019L1024

RODO: https://eur-lex.europa.eu/legal-content/PL/TXT/?uri=CELEX:32016R0679

Regulacje krajowe:

Ustawa o otwartych danych: https://isap.sejm.gov.pl/isap.nsf/DocDetails.xsp?id=WDU20210001641

Prawo autorskie: https://isap.sejm.gov.pl/isap.nsf/DocDetails.xsp?id=WDU19940240083

Regulacje międzynarodowe:

Konwencja o różnorodności biologicznej: https://www.cbd.int/convention/text/

Protokół z Nagoi: https://www.cbd.int/abs/doc/protocol/nagoya-protocol-en.pdf

Standardy i wytyczne GBIF:

https://www.gbif.org/publishing-data

https://www.gbif.org/data-quality-requirements

https://dwc.tdwg.org/

Licencje:

CC0: https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/

CC-BY: https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/

Czym jest Polski Węzeł GBIF?

Polski Węzeł Global Biodiversity Information Facility (GBIF) stanowi krajowy element globalnej infrastruktury danych o bioróżnorodności. Jego głównym celem jest wspieranie instytucji działających w Polsce w zakresie publikowania, udostępniania oraz efektywnego wykorzystywania danych przyrodniczych.

Działalność Polskiego Węzła GBIF jest finansowana w ramach projektu "Polski Węzeł Global Biodiversity Information Facility" realizowanego na podstawie Umowy Nr 2023/WK/09 dotyczącej programu „Wsparcie udziału polskich zespołów naukowych w międzynarodowych projektach infrastruktury badawczej”. Projekt jest prowadzony zgodnie z zapisami umowy oraz jej późniejszymi aneksami.

Umowa została zawarta z Ministerstwo Edukacji i Nauki, którego kompetencje obecnie realizuje Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego. Finansowanie to umożliwia rozwój krajowej infrastruktury danych o bioróżnorodności oraz aktywne uczestnictwo Polski w międzynarodowej sieci GBIF.

Lider projektu

Liderem Polskiego Węzła GBIF jest Uniwersytet Warszawski (Kierownik projektu: dr Piotr Tykarski), który odpowiada za koordynację działań na poziomie krajowym. Zespół węzła wspiera instytucje w zakresie:

• przygotowania danych do publikacji,
• stosowania standardów (np. Darwin Core),
• korzystania z narzędzi GBIF,
• budowania kompetencji w zakresie zarządzania danymi.

Główne cele Polskiego Węzła GBIF obejmują:

• zwiększenie dostępności danych o bioróżnorodności z Polski,
• wspieranie otwartego dostępu do danych naukowych,
• rozwój współpracy między instytucjami,
• wspieranie badań naukowych i działań na rzecz ochrony przyrody,
• dostarczanie danych do raportowania w ramach międzynarodowych zobowiązań, takich jak Convention on Biological Diversity.

Partnerzy Projektu:

• Instytut Botaniki im. W. Szafera Polskiej Akademii Nauk
• Instytut Dendrologii Polskiej Akademii Nauk
• Instytut Oceanologii Polskiej Akademii Nauk
• Instytut Systematyki i Ewolucji Zwierząt Polskiej Akademii Nauk
• Muzeum Górnośląskie w Bytomiu
• Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu
• Uniwersytet Gdański
• Uniwersytet Jagielloński
• Uniwersytet Łódzki
• Uniwersytet Marii Curie–Skłodowskiej
• Uniwersytet Rolniczy im. Hugona Kołłątaja w Krakowie
• Uniwersytet Śląski w Katowicach
• Uniwersytet Wrocławski

Instytucje te pełnią rolę wydawców danych (publishers) i udostępniają swoje zbiory poprzez infrastrukturę GBIF.

Dlaczego to ważne?

Dzięki działalności Polskiego Węzła GBIF dane o polskiej bioróżnorodności stają się częścią globalnego zasobu wiedzy. Umożliwia to:

• lepsze poznanie i monitorowanie przyrody,
• podejmowanie decyzji opartych na danych,
• udział Polski w międzynarodowych inicjatywach naukowych i środowiskowych.

Instytut Dendrologii Polskiej Akademii Nauk to jedna z wiodących jednostek naukowych w Polsce zajmujących się badaniami nad drzewami i krzewami, ich biologią, ekologią oraz różnorodnością genetyczną. Instytut aktywnie uczestniczy w udostępnianiu danych o bioróżnorodności poprzez Global Biodiversity Information Facility (GBIF), przyczyniając się do rozwoju otwartych zasobów danych naukowych.

Rola Instytutu w GBIF

Instytut Dendrologii PAN pełni funkcję wydawcy danych (data publisher), co oznacza, że:

• udostępnia zweryfikowane dane naukowe dotyczące występowania gatunków,
• publikuje dane zgodnie z międzynarodowymi standardami (np. Darwin Core),
• zapewnia wysoką jakość i wiarygodność udostępnianych informacji.

Dzięki temu dane Instytutu są dostępne globalnie i mogą być wykorzystywane w badaniach naukowych, analizach środowiskowych oraz działaniach na rzecz ochrony przyrody.

Koordynatorem działań Instytut Dendrologii Polskiej Akademii Nauk w projekcie Polski Węzeł Global Biodiversity Information Facility jest dr hab. Dominik Tomaszewski, prof. ID PAN.

Funkcję menadżera danych oraz głównego punktu kontaktowego dla badaczy Instytutu w zakresie publikowania danych w GBIF pełni dr Karolina Sobierajska, która wspiera proces przygotowania i udostępniania zbiorów danych zgodnie z obowiązującymi standardami.

Profil w GBIF

Dane publikowane przez Instytut można przeglądać bezpośrednio w portalu GBIF:

• https://www.gbif.org/publisher/f7259790-9300-11da-8596-b8a03c50a862

Na profilu wydawcy dostępne są informacje o instytucji oraz lista wszystkich opublikowanych zbiorów danych.

Instytut Dendrologii PAN publikuje m.in. dane dotyczące:

• występowania gatunków drzew i krzewów,
• kolekcji dendrologicznych,
• obserwacji terenowych i badań naukowych.

Zbiory danych dostępne w GBIF:

• Institute of Dendrology PAS Woody Plant Occurrence Dataset (Poland) - https://www.gbif.org/dataset/f7c496b0-9300-11da-8596-b8a03c50a862
• Juniperus occurrences from research collections of the Institute of Dendrology, Polish Academy of Sciences - https://www.gbif.org/dataset/ef062cb4-8ff4-46c4-b926-f5e4063973ab

Każdy zbiór danych posiada:

• szczegółowy opis (metadata),
• informacje o źródle i metodologii,
• unikalny identyfikator DOI umożliwiający cytowanie.
• Znaczenie publikowanych danych

Dzięki udostępnianiu danych poprzez GBIF, Instytut:

• wspiera globalne badania nad bioróżnorodnością,
• zwiększa widoczność polskich danych naukowych,
• umożliwia ich wykorzystanie w analizach zmian środowiskowych i klimatycznych.

Publikowanie danych w modelu otwartym przyczynia się do rozwoju nauki oraz lepszego zrozumienia procesów zachodzących w środowisku naturalnym.

Jeśli jesteś badaczem z Instytutu Dendrologii Polskiej Akademii Nauk i chcesz opublikować dane o bioróżnorodności pochodzące z Twoich badań w Global Biodiversity Information Facility (GBIF), skontaktuj się z menadżerem danych:

Karolina Sobierajska
e-mail: Ten adres pocztowy jest chroniony przed spamowaniem. Aby go zobaczyć, konieczne jest włączenie w przeglądarce obsługi JavaScript.
tel. wew. 136
kom. 575 770 669

Wsparcie obejmuje m.in. przygotowanie danych do publikacji, dostosowanie ich do standardów (np. Darwin Core) oraz przeprowadzenie procesu publikacji w GBIF.